当商品发生折让时，入库的处理应该遵循以下步骤：

确认折让金额：

首先确认商品折扣的具体金额或百分比。

调整入库成本：

将折让金额从商品的原成本中扣除，得到实际的入库成本。

记录入库：

在进销存系统中，按照折扣后的金额记录商品的入库。

账务处理：

在账务处理中，将折扣额以负数形式计入相关成本或费用科目，以反映折扣对成本的影响。

例如，如果商品原价为100元，发生10%的商业折扣，则实际入库成本为90元。在账务处理中，应记录为：

借：库存商品 90元

贷：银行存款 90元

请注意，商业折扣直接转入成本，不需要单独做账。