制药工程考研可以选择的专业主要包括：

药学专业：

研究药物化学、药物结构、药物作用、药物代谢等方面的学科。

中药学专业：

涉及中药学的基础理论、基本知识、基本技能，以及相关的中医学、药学等知识。

药理学专业：

研究药物与机体间的相互作用规律及其作用机制。

药剂学专业：

研究药物制剂的基本理论、处方设计、生产工艺、合理应用等。

药事管理专业：

涉及药品生产、流通、使用等环节的管理。

微生物与生化药学专业：

研究微生物和生化技术在制药中的应用。

发酵工程专业：

涉及生物发酵技术在制药中的应用。

化学工程专业：

学习化学工程的基本原理和技术，应用于制药生产。

生物医学工程专业：

结合生物学和工程技术，研究生物系统和相关医疗设备的开发。

生物制药专业：

研究生物技术和生物制品在制药中的应用。

选择考研专业时，建议根据自己的兴趣、专业背景以及未来职业规划进行综合考虑