西南科技大学拥有多个优秀的专业，其中一些被认为是王牌专业。以下是一些可能被认为是最好的专业：

材料科学与工程：

这个专业培养具备工程技术领域基础知识、材料科学与工程专业基本理论的高端技术技能型人才，毕业后可以在原材料及高分子材料、新式工程建筑建筑装饰材料、航空航天等公司工作。

自动化：

以电工技术、电子技术、控制理论等为基础，毕业生可以在科研院所、高科技公司、工业与民用部门、行政管理机关等单位从事自动化专业的系统分析与综合、系统集成与运行等工作。

环境工程：

培养具备城市和城镇水、气、声、固体废弃物等污染控制和城市给排水工程等方面知识和能力的环境工程学科高级工程技术人才。

农学：

为国家级特色专业建设点，四川省卓越农林人才专业。

计算机科学与技术：

计算机类专业在西南科技大学中排名较高，投档线为559分。

电子信息工程：

电子信息类专业在西南科技大学中也有很好的排名，投档线为554分。

机械设计制造及其自动化：

机械类专业在西南科技大学中一直处于国内一流水平。

环境工程：

环境工程是国家级特色专业，培养具备城市和城镇水、气、声、固体废弃物等污染控制和城市给排水工程等方面知识和能力的环境工程学科高级工程技术人才。

生物技术：

生物技术等专业入选国家级一流专业建设点。

信息安全：

信息安全等专业在西南科技大学中也有很好的排名。