差额纳税的记账方法主要包括以下几个步骤：

准备可抵扣税收的发票

确保发票上注明了具体的缴纳对象、抵扣的期数以及抵扣金额。

确定当期应纳税额

根据企业的纳税情况，按照财务会计规定将税前损益转至收入科目，并计算应纳税额。

登记当期应付款及发票情况

对相关数据进行核对，确保账目清晰。

计算实际缴纳税收金额

将当期可抵扣税收减去已抵扣税收的金额，得到当期实际缴纳税收金额。

会计分录

销项税额：

借：应收账款

贷：主营业务收入

贷：应交税费-应交增值税（销项税）

允许差额征税的成本发票：

借：应付账款

贷：主营业务成本

贷：应交税费-应交增值税（销项税抵减）

发票备注

在记账凭证中明确标注该发票为差额征税的发票，并在备注栏中注明“差额征税”字样。

期末处理

如果存在期末一次性进行账务处理的情况，需要按规定当期允许扣减销售额而减少的销项税额，借记“应交税费——应交增值税（营改增抵减的销项税额）”科目，贷记“主营业务成本”等科目。

金融商品转让

若金融商品实际转让月末产生转让收益，则按应纳税额借记“投资收益”等科目，贷记“应交税费——转让金融商品应交增值税”科目；若产生转让损失，则可结转下月抵扣税额。

缴纳增值税

缴纳增值税时，借记“应交税费——转让金融商品应交增值税”科目，贷记“银行存款”等科目。

年末处理

年末时，如果本科目（应交税费——转让金融商品应交增值税）有借方余额，则借记“投资收益”等科目，贷记“应交税费——转让金融商品应交增值税”科目。

请根据您的具体业务类型和税法规定，选择合适的会计处理方法。