当公司支付股东工资时，会计处理通常如下：

1. 如果股东在公司任职，其工资可以根据其工作部门计入相应的费用科目，如管理费用或销售费用。

2. 计提工资的会计分录为：

借：管理费用—工资 或 销售费用—工资

贷：应付职工薪酬—工资

3. 实际发放工资时的会计分录为：

借：应付职工薪酬—工资

贷：银行存款

应交税费—应交个人所得税

需要注意的是，如果股东在公司任职并且通过工资表发放工资，这部分工资应视作普通职工薪酬，在费用里核算，并且需要按照“工资、薪金所得”项目缴纳个人所得税