山东自考更换主考院校的操作流程如下：

更换主考院校不更换专业

考生只需按照心仪的主考院校的考试计划进行备考。

在毕业申请时选择新的主考院校即可。

更换主考院校同时更换专业

考生需要携带准考证和课程合格证书到山东省内的市、县（区）自考办提出申请。

填写转考专业登记表，并由自考办签署意见后方可改报新的专业和主考院校。

请注意，如果考生只是更换主考院校而不改变所学专业，则无需办理复杂手续，直接按照新的考试计划进行考试并在毕业申请时选择新的主考院校即可。