同安区拥有许多优秀的学校，以下是部分备受推崇的学校列表：

小学

同安第一实验小学：

历史悠久，分为双溪校区与芸溪校区，现代化设施完备。

大同中心小学：

创办于1925年，位于同安县城洗墨池的宋代科学家苏颂故居“芦山堂”。

同安第二实验小学：

位于同安银湖路，是福建省示范小学、素质教育先进校。

同安第三实验小学：

提供全面的教育资源和丰富的课外活动。

中学

福建省同安第一中学：

公办完全中学，福建省一级达标中学，历史悠久。

启悟中学：

同安县立初级中学为前身，是当地最早的中学之一。

国祺中学：

厦门地区第一所由华侨独资捐建的全日制完全中学。

厦门市双十中学：

创办于1919年，是福建省重点中学，省级文明学校。

厦门市第一中学：

创办于1906年，是福建省普通高中一级达标学校。