运输企业在做账时，主要涉及以下几个方面：

收入确认

主营业务收入：运输企业收到的运费应计入主营业务收入。

会计分录：

贷：主营业务收入

应交税费-应交增值税（销项税额）

借：预付账款

贷：银行存款

其他间接费用：如车队管理人员工资、办公费、水电费等，不能直接计入营运成本和辅助成本，应计入其他间接费用。

会计分录（例如支付货运车维修费）：

借：劳务成本-运输成本

贷：库存现金

进货运费

采购货物成本：自己支付的进货运费应计入采购货物成本。

会计分录：

进货对方代垫运费

实际支付运费：若对方代垫运费，实际还是本企业付运费，会计分录如下：