高考539分能上的大学取决于省份和当年的录取分数线情况，以下是一些可能的选项：

文科

上海师范大学（中外合作）：最低录取分数线为539分。

宁波大学（中外合作）：539分左右可以考虑。

江苏师范大学：539分可以尝试报考。

嘉应学院（湖南文科）：539分左右可以考虑。

皖西学院（湖南文科）：539分左右可以考虑。

防灾科技学院（河北文科）：539分左右可以考虑。

大连理工大学（上海）：539分可以尝试报考。

北京交通大学（上海）：539分可以尝试报考。

厦门理工学院（较高收费）：最低539分。

大连交通大学：最低539分。

浙大城市学院：最低539分。

深圳北理莫斯科大学：最低539分。

广西民族大学：最低539分。

宜春学院：最低539分。

江汉大学：最低539分。

西南科技大学：最低539分。

湖北大学：最低539分。

温州大学：最低539分。

理科

天津商业大学：最低分539分。

天津体育学院：最低分539分。

南通大学：最低分539分。

重庆交通大学：最低分539分。

第四军医大学：最低分539分。

北京建筑大学：最低分539分。

山东建筑大学：539分可以尝试报考。

上海电机学院：539分可以尝试报考。

湖南工商大学：539分可以尝试报考。

河南师范大学：539分可以尝试报考。

请注意，以上信息仅供参考，具体能否被录取还需考虑当年的实际录取分数线和报考人数等因素。建议考生和家长关注官方招生考试院发布的最新消息，以获得最准确的报考信息