惠州学院拥有多个系部，其中包括但不限于以下几个系：

电子科学系

服装系

化学工程系

计算机科学系

经济管理系

建筑与土木工程系

旅游系

美术系

数学系

生命科学系

体育系

外语系

音乐系

中文系

政治法律系

思想政治理论课教学部

其中，计算机科学与技术系和美术系是惠州学院较为知名的系部。计算机科学与技术系专注于计算机科学技术的研究与教学，涵盖软件开发、网络工程、人工智能等方向。美术系则致力于学科专业建设，培养具有专业知识、实践能力和创新思维的应用拓展型高素质人才。

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