上海最好的大学通常根据不同的排名标准和时间点有所变化，但根据最近的信息，复旦大学和上海交通大学通常被认为是在上海乃至全国都极具竞争力的顶尖学府。以下是部分排名信息：

复旦大学

复旦大学是教育部直属的985和211大学，拥有多个双一流建设学科和ESI排名全球前1%的学科领域。

在最新的QS世界大学排名中，复旦大学位列全球第40位，国内高校第3位。

上海交通大学

上海交通大学是教育部直属的985和211大学，也是国家“双一流学科”建设高校。

在第四轮学科评估中，机械工程、船舶与海洋工程、生物学、临床医学、工商管理共同入选A类学科。

根据2024年5月1日的信息，复旦大学和上海交通大学在全国的排名中均位于前列，其中复旦大学位于全国第6位，上海交通大学位于全国第3位。

请注意，大学排名可能会随着时间和不同评价机构的标准而有所变化，因此建议查看最新的排名信息以获得最准确的判断