地质工程专业的顶尖院校包括：

中国地质大学（武汉和北京）：

该校的地质工程是国家一级重点学科，并在全国享有很高的声誉。

吉林大学：

地质工程专业同样是国家一级重点学科，并且有较高的录取分数线。

成都理工大学：

地质工程也是该校的国家一级重点学科。

南京大学：

在综合因素考量下，南京大学被认为是地质工程专业最好的大学之一。

长安大学：

地质工程是该校的二级学科国家重点学科。

中国矿业大学（徐州和北京）：

该校的地质工程专业也受到了高度认可。

中国石油大学（北京和华东）：

石油大学在地质工程领域也有很强的实力。

中南大学：

在地质工程方面同样表现出色。

同济大学：

该校的地质工程专业也是国家特色专业。

西北大学：

地质工程作为二级学科国家重点学科，西北大学在此领域也有很好的表现。

以上排名可能会随着时间和各种评价标准的变化而有所调整，建议在选择学校时，还需参考最新的排名信息和学校自身的特色。