当企业遇到不能抵扣的进项税时，可以采取以下几种处理方式：

计入成本或费用：

将不能抵扣的进项税额计入相关资产或费用科目，作为当期损益处理。

无票收入：

企业可以通过一笔无票收入，使得增值税销项税金等于或略大于留抵的进项税金，实现平进平出，不交增值税或者交少量增值税。

退税：

如果进项税不能抵扣是因为购买的货物或服务被退货或退款，企业可以向税务机关申请退税。

转出：

如果企业购进的货物或服务用于非增值税纳税人的生产经营活动，可以将进项税转出。

不予认证：

如果进项税是因为发票问题无法认证，可以不予认证，不予以抵扣。

成本摊销：

将无法抵扣的增值税进项税额作为企业成本进行摊销，并计入成本费用中。

其他税收减免：

根据税法规定，某些特定操作或行业可能有特殊税收减免政策，企业可以查询相关法规或咨询税务机关。

其他费用扣除：

企业可以将不能抵扣的增值税进项税额作为其他杂费开展扣减，从而降低公司的应纳税额。

暂不处理：

如果进项税额不足以抵扣应纳税额，可以留待下一个纳税期抵扣。

补缴税款：

如果进项税额不足以抵扣应纳税额，企业可以选择在规定的时间内补缴税款。

申请退税：

如果进项税额明显超过应纳税额，企业可以向税务机关申请退税。

请注意，在处理不能抵扣的进项税时，企业应遵守税法和会计准则的规定，确保会计处理的准确性和合法性