连锁药店做账的步骤通常包括以下几个方面：

初始设置

确定会计科目，包括资产类、负债类、所有者权益类、成本类和损益类。

建立账簿，包括总账和明细账。

日常业务处理

根据原始凭证编制记账凭证，并登记明细分类账。

处理采购药品、销售药品、医保结算、支付员工工资、计提固定资产折旧等业务。

期末处理

对损益类科目进行结转。

进行计提、摊销、结账和对账，确保账证相符、账账相符、账实相符。

编制会计报表

根据登记好的会计账簿编制资产负债表、利润表等财务报表。

财务分析与保管

对财务报表进行分析说明。

将记账凭证装订成册，妥善保管。

使用ERP（企业资源计划）系统可以帮助连锁药店更高效地管理财务信息，通过电脑管理软件可以清晰地查看每天的日常细节和日报表。

请注意，以上步骤可能会根据具体的会计政策和所在国家的会计准则有所不同。连锁药店应遵循当地的财务会计准则和相关法律法规进行账务处理