在进行企业所得税汇算清缴时，可以扣除的费用主要包括：

合理的工资薪金支出：

可以100%全额扣除。

职工福利费支出：

按照不超过工资薪金总额的14%标准扣除。

职工教育经费支出：

按照工资薪金总额的8%扣除，超出部分可在以后纳税年度结转扣除。

研发费用支出：

加计扣除比例为75%，形成无形资产的，在上述期间按照无形资产成本的175%在税前摊销。

补充养老保险和补充医疗保险支出：

不超过工资薪金总额5%的部分，准予扣除。

业务招待费支出：

按照发生额的60%扣除，但最高不得超过当年销售（营业）收入的5‰。

广告费和业务宣传费支出：

一般企业不超过当年销售（营业）收入15%的部分准予税前扣除；超过的部分准予在以后年度结转扣除。

公益性捐赠支出：

不超过年度利润总额12%的部分准予扣除。

其他扣除项目：

如职工工会经费、党组织经费、手续费及佣金等，具体比例依据相关规定而定。

请注意，上述扣除项目和比例可能受到最新税法规定的影响，因此在进行汇算清缴时应以最新的税法规定为准。