公司补交个人所得税的步骤通常包括：

核实漏缴税款

确定漏缴税款的具体金额和时间。

计算补缴金额

包括应缴未缴的税款和可能的滞纳金。

准备申报资料

准备员工工资明细、税前扣除项目凭证等相关资料。

填写纳税申报表

根据税务部门的要求，填写《个人所得税自行纳税申报表》。

注明补缴原因，并计算应补缴的税款。

提交申报

将申报表和相关资料提交至所在地税务部门。

缴纳税款

根据税务部门出具的通用缴款书，到指定银行进行缴税。

保存缴税凭证

妥善保存缴纳税款的凭证，以备后续查询或核查。

接受审核

税务部门审核通过后，企业将收到缴税凭证，完成补税流程。

请注意，补税时务必确保申报信息的准确性，避免因错误申报而产生不必要的麻烦。