材料合理损耗的处理方式如下：

原材料入库后的合理损耗

损耗数量和质量根据预设标准确定。

记录财务账目并计算损耗金额。

将金额录入会计账簿并调整支出账户。

在库存管理系统中登记损耗。

材料采购途中的合理损耗

损耗部分金额不扣除，计入购进材料的总成本中。

如果采用实际成本法核算，计入“原材料”科目。

如果采用计划成本法核算，计入“材料采购”科目。

原材料盘亏，未查明原因

会计分录为：借：待处理资产损溢——待处理流动资产损益 贷：原材料。

查明原因后属于合理损耗

会计分录为：借：管理费用 贷：待处理资产损溢。

物资在运输途中的短缺与损耗

除合理的途耗应计入物资的采购成本外，非正常损耗且能确定由过失人负责的，按过失人负责处理。

期末结转本年利润

将管理费用结转至本年利润。

以上处理方式应结合企业的具体情况和会计政策进行。