运输废料的费用通常应计入以下科目之一，具体取决于废料的处理方式和企业内部的财务制度：

间接费用--运输费科目

适用于废料被运输用于其他目的，如销售或回收。

包括使用交通工具（如火车、船舶、汽车等）产生的运费。

管理费用

如果废料的处理不产生直接收入，且主要是管理活动的一部分，则费用可计入管理费用。

其他业务支出

当企业将废料重新加工或用于其他业务活动时，产生的转运费可以计入其他业务支出。

财务费用

如果企业从废料处理中获得收入，并且支付运费是获取这些收入的一部分成本，则运费可以计入财务费用。

其他应收款

如果运费由收货方支付，则可能会计入其他应收款。

请根据您的具体情况选择合适的科目进行会计处理。