当纳税人多缴了税款，处理方式通常有以下几种：

退还多缴税款

税务机关在发现后会立即退还多缴的税款。

如果纳税人在自结算缴纳税款之日起三年内发现多缴，可以向税务机关提出退还要求，并可以要求加算银行同期存款利息。

如果涉及从国库中退库，将依照相关法律、行政法规的规定进行。

抵缴应纳税款

多缴的税款也可以用来抵缴纳税人下一年度的应纳税款。

在企业所得税季度申报表中，多缴的税款可以在预缴时抵减，年度汇算清缴时填在相应的栏目。

抵缴欠税款

如果纳税人同时存在应退税款和欠缴税款，税务机关可以将应退税款和利息先抵扣欠缴税款。

申请退税手续：

纳税人需要填报《退（抵）税申请表》并提供完税费（缴款）凭证复印件。

退税款通常会退回到纳税人原来的缴税账户。

注意事项：

如果纳税人在结清缴纳税款之日起3年后才提出退还多缴税款的要求，税务机关将不予受理。

退税的具体流程和要求可能因地区而异，建议纳税人联系当地税务机关获取详细信息。