主治医师资格证书的发放时间因国家和地区而异，通常由当地的卫生行政部门或专业认证机构负责。在中国，主治医师资格证书的发放流程一般如下：

1. 通过国家统一的执业医师资格考试。

2. 经过一定年限的临床实践。

3. 由所在医院推荐。

4. 经过卫生行政部门的评审和认证。

证书的具体发放时间没有统一标准，通常在考试结束后的第二年四、五月份，但具体时间需要咨询当地的卫生行政部门或相关认证机构。