员工退股的入账流程通常包括以下几个步骤：

确认退股金额

公司根据退股协议确认应退还给员工的股金金额。

减少股本

在“股本”科目下借记相应的金额，表示减少公司的股本。

处理资本公积

如果员工退股时涉及到资本公积，则需要在“资本公积”科目下贷记相应的金额。

处理利润分配 （如有）：

如果退股涉及到利润分配，则需在“利润分配”科目下贷记相应的金额。

支付退股款项

借记“库存现金”或“银行存款”科目，以支付退还的股金。

处理盈余公积（如有）：

如果退股涉及到盈余公积，则需在“盈余公积”科目下借记相应的金额，以反映因退股而减少的盈余公积。

处理应付款项（如有）：

根据退股的金额，在“应付款项”科目下借记相应的金额，表示公司对员工的负债。

在整个过程中，需要确保借贷平衡，即借方总额等于贷方总额，以保持会计等式平衡。

请根据公司的具体情况和适用的会计准则进行相应的账务处理。