工程中的“三超”指的是在工程建设过程中出现的三个主要问题，具体如下：

概算超估算：

在项目初期，设计概算超出了最初的投资估算。

预算超概算：

在项目实施过程中，施工预算超出了设计概算。

结算超预算：

在项目结束时，实际结算超出了施工预算。

这三个问题通常是由于项目风险估计不足、建设过程中变更频繁、建设组织模式陈旧等原因造成的，可能导致投资增加和工程造价上涨。