处理进项负数发票的入账，请按照以下步骤进行：

检查原因

确定负数发票的原因，如退货、折扣、冲红等。

会计科目调整

根据原因，在相应的会计科目中进行调整。例如，退货需在“库存商品”或“原材料”科目中贷记处理。

借贷记账

在会计账簿上，按照“借方”和“贷方”的原则进行记账。对于负数发票，借方金额为负数，贷方金额为正数。

账务处理

在财务软件中，找到相应的发票记录，输入负数金额，确保借贷方金额正确。

对账确认

将负数发票的入账情况与供应商进行核对，确保双方账目一致。

报表反映

在财务报表中，根据负数发票的影响，调整相应的项目，如应交税费、存货等。

存档归档

将负数发票及其处理记录进行归档，以备后续审计或查询。

请注意，如果之前已经将对应的税额作为进项税额核算，则应做进项税额转出处理。如果尚未勾选确认进项税额，则做相反分录进行冲减。