建造师证书的注销流程通常如下：

登录注册系统

个人或企业需要登录中国建造师网或相关省级注册管理系统。

填写注销申请

个人用户登录后，在系统中选择“注销注册”并填写必要的信息。

企业用户登录后，同样需要选择“注销注册”，并由企业审核后上报。

提交注销申请

个人申请后，需要通知企业登录系统进行确认并上报。

企业上报成功后，个人或企业版操作即完成。

等待审核

提交注销申请后，需要等待相关部门进行审核。

注销完成

审核通过后，建造师证书将被注销，并可以打印注销申请表作为证明。

请注意，注销流程可能因地区或政策更新而有所变化，建议直接访问中国建造师网或联系当地的建设厅或相应管理部门获取最新信息。

另外，如果企业不配合注销，可以尝试在中国建造师网上进行注销申请，并可通过电话向当地住建局和住建厅举报，或者通过劳动仲裁等法律途径解决。