处理多抵扣进项税的方法主要包括以下几个步骤：

核对抵扣凭证

确保所有抵扣凭证真实有效，符合税务规定。

调整账目

将多抵扣的进项税金额调整到正确的账目科目中。

申报调整

在税务申报时，按照实际抵扣金额进行申报，避免虚假申报。

咨询专业人士

如有需要，可咨询税务专家或会计师，确保处理合规合法。

调整会计核算方法

根据企业实际情况和税收政策要求，合理设置会计科目和核算方法，确保进项税额的准确性和合规性。

进项税额转出

对于非正常业务抵扣的进项税额，要做进项税务转出处理。

转出账务处理示例：借：库存商品、管理费用等，贷：应交税费-应交增值税-进项税额转出。

开具红字发票

如果进项发票金额多开，已抵扣，可以通过开具红票的方式进行账务处理。

报表调整

在增值税报表中，将多抵扣的进项税额填在增值税申报表二做进项税额转出。

内部控制

建立健全内部控制机制，规范税务处理流程，确保税务处理的准确性和合规性。

请根据具体情况选择合适的处理方法，并确保遵循相关税法规定。