物流承包业务的账务处理主要包括以下几个方面：

收入确认

当收到运输服务费用时，应借记“库存现金”、“银行存款”或“应收账款”，贷记“主营业务收入”。

成本核算

成本主要包括工资、燃油、过路费、联运费用等。

成本核算时，借记“主营业务成本”科目，贷记相应的资产科目，如“应付账款”等。

税金处理

根据相关税法规定，计算并缴纳增值税、营业税、城建税、教育费附加、地方教育费附加、印花税、所得税等。

计提税金时，借记相关费用科目，贷记“应缴税费”科目。

实际缴纳税金时，借记“应缴税费”科目，贷记“银行存款”科目。

发票管理

收到运输服务发票后，进行账务处理，借记“应付账款”，贷记“管理费用”或“销售费用”等。

报表编制

根据明细账和总账编制会计报表，并进行分析说明。

纳税申报

根据会计报表和纳税规定，进行纳税申报工作。

会计档案

将记账凭证装订成册，妥善保管。

请注意，具体的会计处理可能因公司的具体情况和所在地的税法规定有所不同。务必遵循当地的会计准则和税法规定进行账务处理。