当企业支付了超过应付货款的金额时，可以通过以下会计分录来处理多付的货款：

1. 记录多付的货款：

借：其他应付款 或 预付账款

贷：银行存款

2. 当实际支付货款时，进行正确的会计分录：

借：应付账款

贷：银行存款

请确保所有会计分录遵循适用的会计准则，以保持财务数据的准确性和合规性。