函授本科毕业生未能获得毕业证书可能有以下原因：

未完成课程：

如果学生未能完成所有的课程要求，则无法获得毕业证书。

毕业论文未通过：

毕业论文是毕业要求的一部分，未通过则不能获得毕业证。

成绩问题：

如果学生的成绩未达到毕业标准，同样无法获得毕业证书。

学校责任：

如果是因为学校方面的原因，如记录错误等，学生可以向教育部门投诉。

毕业证书是学生完成学业并达到毕业条件的证明，而学位证书则需要学生自己申请，并且满足特定条件，如通过学位考试等。