付款申请单做账的步骤如下：

准备付款申请单

包含基本信息（申请人、申请日期、收款方名称及银行账户信息等）。

申请事由（详细说明付款用途，如采购原材料、支付租金或员工工资等）。

金额明细（列出每一笔款项的具体数额及其对应项目）。

审批流程（明确付款申请的审核层级）。

内部审批

填写付款申请单后，进行内部审批流程。

财务付款

财务根据经过审批的付款申请单进行付款。

会计分录

付款时，会计分录一般为：

借：应付账款（或其他应付款等科目）

贷：银行存款

其中，“应付账款”科目核算企业因购买材料、商品和接受劳务供应等经营活动应支付的款项。

记录与核对

在系统中确认支付，并同步更新会计凭证。

仔细核对信息无误，确保账务一致性。

请确保在处理付款申请单时，所有步骤都严谨对待，保证数据的准确性。