肽键不能自由旋转的原因在于它具有部分双键性质。具体来说：

1. 肽键中的C—N键长介于单键和双键之间，这表明C—N键中的电子云有一定程度的重叠，导致其不能像普通的单键那样自由旋转。

2. 肽键的局部双键性质来自于羰基（-CO-）和氨基（-NH-）之间的电子共享，这种电子的共振结构使得肽键具有额外的刚性，进一步限制了旋转自由度。

3. 由于肽键的平面性，围绕肽键的旋转（即ω角）通常被固定在接近180°的反式构象。

这些特性使得肽键及其相连的原子更倾向于维持在一个固定的平面构象上，对于蛋白质的空间结构至关重要。