当处理跨年度的退税入账时，以下是会计分录的处理方法：

出口货物单证不齐的情况

本年出口货物单证不齐，在本年视同内销征税时，应冲减出口销售收入，增加内销销售收入。

借记“主营业务收入--出口收入”科目，贷记“主营业务收入--内销收入”科目。

按照单证不齐出口销售额乘以征税税率计提销项税额，借记“主营业务成本”科目，贷记“应交税费--应交增值税（销项税额）”科目。

上年出口货物单证不齐的情况

按照单证不齐出口销售额乘以征税税率计提销项税额，借记“以前年度损益调整”科目，贷记“应交税费--应交增值税（销项税额）”科目。

按照单证不齐出口销售额乘以征退税率之差冲减进项税额转出，借记“以前年度损益调整”（红字）科目，贷记“应交税费--应交增值税（进项税额转出）” （红字）科目。

按照单证不齐出口销售额乘以退税率冲减免抵税额，借记“应交税费--应交增值税（出口抵减内销应纳税额）” （红字）科目，贷记“应交税费--应交增值税（出口退税）” （红字）科目。

所得税汇算清缴后的退税处理

按退税金额，借记“应交税费--应交所得税”科目，贷记“以前年度损益调整”科目。

收到退回的税款时，借记“银行存款”科目，贷记“应交税费--应交所得税”科目。