在Pro/E 4.0中进行公差标注，您可以按照以下步骤操作：

1. 打开Pro/E软件，并打开需要进行公差标注的零件或装配体。

2. 在工具栏中选择“标注”工具。

3. 在标注工具栏中选择“公差”标注类型。

4. 在模型上单击鼠标左键，选择要标注的特征或面。

5. 在尺寸文本中输入公差值，使用以下格式：`@oΦ100@&43；&43；0.01@@--0.01`。

`@o` 代表字母 `O`，其后是输入的尺寸，例如 `Φ100`。

`@&43；` 代表上公差，`&43；0.01` 表示输入的上公差值。

`@` 是上下公差的间隔符。

`@-` 代表下公差，`-0.01` 表示输入的下公差值。

6. 根据需要调整标注的位置和大小。

7. 保存文件并输出图纸。

请注意，公差标注的具体操作可能会因Pro/E版本的不同而略有差异，以上步骤以Pro/E 4.0为参考。如果您使用的是其他版本的Pro/E，操作步骤可能会有所不同。