扣员工工资做账的步骤如下：

计提工资

借：管理费用——工资

贷：应付职工薪酬——工资

发放工资

借：应付职工薪酬——工资

贷：银行存款

其他应收款——代扣款项（如社保、公积金、罚款等）

代扣款项

如果扣款是社保或公积金：

借：其他应付款——代扣社保/公积金

贷：应付职工薪酬——社保/公积金

实际缴纳时：

借：应付职工薪酬——社保/公积金

贷：银行存款

如果扣款是罚款或其他应收款：

借：其他应收款——代扣款项

贷：管理费用/营业外收入（取决于罚款性质）

实际扣除时：

借：应付职工薪酬——工资

贷：其他应收款——代扣款项

请根据具体情况选择相应的会计分录进行记录。