商丘市拥有以下本科学校：

1. 商丘师范学院

主管部门：河南省教育厅

所在地：商丘市

办学层次：本科

备注：省属公办全日制普通高等学校，河南省示范性应用技术类型本科院校。

2. 商丘工学院

主管部门：河南省教育厅

所在地：商丘市

办学层次：本科

备注：民办普通本科高校，以工学为主，多学科协调发展。

3. 商丘学院

主管部门：河南省教育厅

所在地：商丘市

办学层次：本科

备注：民办普通本科高校，原名河南农业大学华豫学院，后独立设置为商丘学院。

以上信息根据最新的教育部高校名单整理得出