培训机构校长辞职应遵循以下步骤：

提交辞职申请

向培训机构所在地的教育行政部门提交辞职申请。

申请中应包含辞职原因和详细说明，并遵循当地规定的程序。

与学校管理层沟通

在递交辞职申请之前，与学校管理层进行沟通，确保辞职决定得到充分理解和支持。

了解具体要求

咨询当地教育行政部门官员，了解有关辞职申请的具体要求和流程。

等待审批

辞职申请通常需要经过审批和确认后才能生效。

办理交接

在辞职获批后，办理工作交接，确保学校运营平稳过渡。

尊重合同条款

遵守与培训机构签订的合同条款，如有违约金等相关规定，应按规定执行。

请确保在整个过程中保持诚信和透明，尊重所有相关方的权益，并尽可能减少给培训机构带来的不便。