发放年终奖应计入“应付职工薪酬”科目。具体会计分录如下：

1. 计提年终奖时：

借：管理费用/销售费用等相关科目

贷：应付职工薪酬——奖金

2. 实际发放年终奖时：

借：应付职工薪酬——奖金

贷：银行存款/库存现金

贷：应交税费——应交个人所得税

以上会计分录反映了企业在计提和发放年终奖时的财务处理。