应付施工款项的账务处理主要包括以下几个步骤：

1. 收到工程发票时的会计分录：

借：在建工程

借：工程施工等

借：应交税费-应交增值税-进项税额

贷：应付账款

2. 实际支付时的会计分录：

借：应付账款

贷：银行存款

3. 工程完工并达到预定可使用状态时，将“在建工程”科目转入“固定资产”科目：

借：固定资产

贷：在建工程

4. 如果涉及预付工程款，则会计分录为：

借：预付账款

贷：银行存款或库存现金

5. 收到发票后，预付账款的减少：

借：在建工程

贷：预付账款

6. 根据工程进度或合同约定，在贷方记入“在建工程”科目，表示工程成本的增加：

借：应付账款

贷：在建工程

以上步骤反映了企业在收到和支付施工款项时的会计处理过程。请根据具体情况调整会计分录。