哈尔滨医科大学是一所省部共建大学，具体建制如下：

主管部门：黑龙江省人民政府

共建单位：教育部

学校类型：教学研究型医科大学

特色：

国家首批试办七年制高等医学教育的院校

省部共建大学

黑龙江省高水平大学和优势特色学科建设高校

国家“中西部高校基础能力建设工程”建设高校

教育部“卓越医生教育培养计划”试点高校

国家建设高水平大学公派研究生项目实施高校

国家“特色重点学科项目”建设高校

国家理科基础科学研究与教学人才培养基地

国家级大学生创新创业训练计划实施高校

临床医学硕士专业学位研究生培养模式改革试点高校

黑龙江省高等医学教育研究基地

中俄医科大学联盟中方牵头单位

学校设有18个二级院部和8个事业单位，提供包括基础医学、公共卫生在内的多个学科的教育和研究。